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Génome minimal

17 Nov 2016

Bioinformatics Dr Doping répète des gènes d'ancêtre communs, en éteignant les gènes de bactéries d'Escherichia coli et de compétition.

Que les approches différentes sont-elles au fait de définir le génome minimal ? Comme les méthodes de recherche de gène expérimentales exécutées qui sont exigées ?

Il y a plusieurs approches à la définition de ce qui est le génome minimal. D'abord - c'est évolutionniste. Il est basé sur la philosophie naturelle que si un certain gène est présent dans tous les organismes, vous ne pouvez pas vous passer probablement de ce gène. Ici il y a en fait une tromperie. Puisque quand je dis que le même gène est présent dans les organismes différents, la question survient et comment font je sais que c'est un et le même gène et c'est tout un et le même gène, quand c'est dans trois différents génomes. La définition évolutionniste est : nous croyons que c'est un et le même gène, s'ils avaient un ancêtre commun et l'histoire de ce gène est exactement la même sorte d'histoire, c'est-à-dire il n'y avait aucune action de copier et les gènes ont différé seulement à la suite de speciation.

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Si vous cultivez des bactéries sur un moyen d'expression, la seule source de carbone qui est, par exemple, fructose et vous avez tué le convoyeur fructose ou avez tué l'enzyme quelles catalyses la première réaction de nutrition fructose, tout dans votre environnement, sauf fructose, rien et la possibilité vous l'avez cassées. Et si vous êtes dans le même environnement versent du glucose, il sera magnifique de vivre et se développer. Ainsi ici nous devons dire que nous leur permettrons de cultiver un environnement riche dans lequel il y a tout dont elle pourrait avoir besoin et regarder le génome minimal un tel environnement. Donc les gens font et c'est aussi la définition raisonnable. C'est plus doux qu'évolutionniste. C'est-à-dire, les gènes qui sont absolument universels, s'abaissent évolutionnistement que les gènes qui sont exigés pour un tel individu est éteint.

Les expériences sont des génomes maintenant minimaux de la plupart des courses par Craig Venter, qui a été impliqué dans le génome humain et échangé ensuite aux génomes de bactéries. Appliqué l'idée que de cette manière il essaie de vendre, je, franchement, pas beaucoup. Puisqu'il a cette idée que nous sommes ici pour faire un génome minimal et ensuite nous y ajouterons facultativement quelques morceaux et ferons commandé par les bactéries, "le design", dont nous avons besoin. Je ne comprends pas vraiment pourquoi il est technologiquement justifié parce que nous pouvons le faire en fait maintenant. Nous pouvons prendre l'E. coli - nous avons un ensemble d'efforts technologiques - et ils peuvent faire le même. Mais Venter dit qu'il n'y aura rien le supplément. D'autre part, ce ne sera certainement rien le supplément, mais sera en même temps tout à fait des morts.

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